水作为生命之源、生产之要、生态之基与每个人的生命和生活息息相关，它不仅直接影响到人们的日常生活生产，而且影响到经济社会发展，甚至影响到社会的和谐稳定。虽近年来，各个机构不断加大了对水源地的保护，但是这是远远不够的，因为与地下水相比，水源地水库的水体生物组成更为复杂，生物的影响作用更加明显。浮游生物在水库水体生态系统中占据重要地位，是运用生物调控手段防止水质富营养化的重点控制对象，在水源地保护中具有重要的指示性作用。因此浮游植物鉴定的种类与数量，作为水质检测项目的补充和完善。通过增加水源地水库浮游植物的鉴定，使水质检测内容更加广泛、更加科学。
1.浮游植物种群数量与水体营养盐含量密切相关
　　某些种类的浮游植物特别喜欢生活在营养丰富的肥沃水体中，一旦发现其大量繁殖而形成优势种群时即可认定该水体营养盐异常丰富，必须引起人们的警惕，从而促使人们认真探查水源地的污染来源，为快速查找污染源提供参考。
2.浮游植物监测有利于预测“水华”暴发
　　当某些种类的浮游植物成为水体中的优势种群大量存在时，人们必须警惕水体发生“水华”的危险，如蓝藻门的铜绿藻、微囊藻、水华微囊藻、假丝微囊藻、水华鱼腥藻，裸藻门中的血红裸藻等是形成“水华”的常见种类。这些种类的浮游植物通常被视为“水华”指标性物种，从而为人们提前预判、进而采取相应措施提供参考，尽量避免发生严重水污染事件。
3.浮游植物在食物链中具有重要作用
　　水体中浮游植物位于植物链中的较低端，是水体中的初级生产者，在食物链中发挥着较重要的作用。通过对其种群与数量的监测可以指导人们运用生物调控手段综合利用浮游植物，保持水体生态平衡。例如可以根据水体中浮游植物数量的多少和种类构成来调整滤食性和其他种类经济鱼类放养密度与比例，从而合理利用和控制水体中浮游植物数量，以达到维持水体生物平衡的目的，增强水体的自我调节能力，避免水质发生剧变。
       以上就是浮游植物鉴定的重要性。水资源的保护及水污染的防治包含了很多方面，在浮游植物鉴定方面也是不容忽视的。